Posteriormente profundiza en el estudio de la Música Antigua mediante los instrumentos de cuerda pulsada (laúd, vihuela, guitarra barroca, tiorba, etc.). De formación autodidacta, ha recibido consejos de prestigiosos laudistas como Lluís Gàsser, William Waters, Paul O'Dette y Rolf Lislevand.
Alfred Fernández es un especialista en el repertorio español para vihuela y guitarra barroca. Sus trabajos de investigación e interpretación de música ibérica inédita, para instrumentos de cuerda pulsada, han recibido numerosos elogios y reconocimiento. En este sentido, su segundo trabajo discográfico Ad hunc modum , ha recibido el apoyo del Departament de Cultura de la Generalitat de Catalunya.
De entre los diversos festivales de música antigua en los que ha participado como solista caben destacar: Festival van Vlaanderen Brugge. 37ste Festival Musica Antiqua (Brujas), II Festival de Otoño de Jaén (Jaén), concierto en el Instituto Cervantes de Atenas (Atenas), "Sacrale Muziek"(St. Truiden, Bélgica), Ciclo de Música Antigua en la Real Capilla de Santa Isabel de Portugal (Zaragoza), "L'Altro Suono". Incontri con la musica antica (Turín), IX cicle "Concerts de Música Antiga" (Xàtiva), etc.
Como miembro de conjuntos ha actuado en: XXIII Festival de Música Antiga (Barcelona), Semana de Música Antigua "Antonio de Cabezón" (Burgos), Festival Internacional de Música de Andorra (Ordino), etc.
Recientemente ha dirigido en el "VI Cicle de Música Antiga" de Badalona, "15è Festival Internacional de Teatre Visual i de Titelles" de Barcelona y en el "Festival d'Òpera de Butxaca" de Barcelona la ópera Venus and Adonis de John Blow al frente de la formación Othello Ensemble de quien es director y fundador.
Por sus trabajos discográficos ha recibido elogiosas críticas en revistas especializadas como Goldberg, , Répertoire, Le Monde de la Musique, The Lute Society Magazine, Bulletin de la Société Française de Luth, etc.
Su último CD como solista, titulado Nunca más verán mis ojos, ha recibido las máximas calificaciones en las revistas especializadas.