Les spécialistes modernes ont confirmé que le compositeur le plus illustre de Séville, et en son temps le plus célèbre d’Espagne, était né le 4 octobre 1528, jour de la saint François, et qu’il s’éteignit un mois après son soixante et onzième anniversaire. Quant à ses quarante-quatre années au service de la cathédrale, elles méritent d’être nuancées. Les inscriptions font sans doute allusion aux vingt années que Guerrero, nommé successeur officiel, passa à attendre le poste de maître de chapelle et aux quelques vingt-cinq années durant lesquelles il assuma cette fonction. En fait il avait été enfant de chœur sans doute dès 1538 puis jeune choriste à partir de 1542, développant ce que l’on qualifia plus tard d’ escogida voz de contra alto (une voix de contralto de superbe qualité). Il reçut sans doute des leçons de composition de Morales en 1545 ou 1546, selon certains à Tolède, selon d’autres à Séville (une ville dans laquelle Morales séjourna peut-être à l’époque). En 1590, Guerrero lui-même déclara avoir été l’élève de son frère aîné Pedro puis de Morales.